Matrix Evolutionia(マトリックスエボリューション:matorikkusu eboryuushon) on kahdenlaista. Toisessa aikuistasoisesta tulee täydellisen asteen digimon, yleensä Sinisen kortin avulla. Toisessa Matrix Evolution -tyypissä kesyttäjä yhdistyy kumppanissa kanssa digimoniksi.